失效只是濫用帶來的一個惡果。它還造成了醫療費用的無謂增長和病患的死亡。抗菌藥在殺菌的同時，也會造成人體損害，如影響肝、腎臟功能、胃腸道反應及引起再生障礙性貧血等。另外，它也可能導致二重感染：在正常情況下，人體的口腔、呼吸道、腸道都有細菌寄生，寄殖菌群在相互作用下維持著平衡狀態。如果長期使用廣譜抗菌藥物，敏感菌會被殺滅，而不敏感菌乘機繁殖，未被抑制的細菌、真菌及外來菌也可乘虛而入，誘發又一次的感染。

　　據專家估計，2005年，由于抗生素的不規范使用導致醫療費用不合理增長達800億元之巨。在不良反應致死的病例中，抗生素濫用也是主要罪魁之一。“20萬死亡患者中，40％是死于抗生素濫用的。”劉勇說。

　　既然后果如此糟糕、如此嚴重，為什么抗生素還在大量無節制地使用呢？一是醫療技術水平的差距，一是利益的誘惑。按照衛生部合理用藥專家委員會副主任委員吳永佩的說法：我國抗生素濫用特征比較明顯，就是檔次偏高而水平偏低。

　　衛生部合理用藥專家委員會調查發現，不合理用藥的最主要原因之一是有藥可用與醫務人員用藥知識不足之間存在著差距。“有的對抗菌藥物的使用基本原則還不十分了解。”吳永佩說，有的婦科抗菌藥物安全性差、不良反應嚴重在國外已經停止和進行嚴格控制，但在我國還在比較廣泛地使用。這也是他堅決支持對基層醫療機構進行合理用藥，特別是抗菌藥物臨床應用知識進行培訓的原因。

　　這種需求也的確存在。在1月8日全國優秀鄉村醫生代表座談會上，代表們希望國家大型醫療機構能夠對基層醫療機構提供技術支持，能夠為基層醫務人員提供技術培訓，其中很重要的培訓內容就是用藥知識的培訓。“我們給縣醫院蓋些房子，買些設備是非常容易的，難就難在相應的服務能力、技術水平的提高。”衛生部醫政司副司長趙明鋼說。

　　專家們提到，抗生素濫用的另一個主因跟以藥養醫的體制密切相關。劉勇稱，“抗菌藥物的濫用在大城市的三級綜合醫院，包括咱們國家非常有名的大醫院同樣存在，并且問題也非常嚴重。”在他看來，大醫院抗生素濫用的根源在補償體制上。

　　在醫院的藥品銷售中，抗生素占著舉足輕重的地位。根據對全國124所三級甲等醫院的調查，2004年，抗菌藥物占醫院藥品總金額的25.7％，后來雖然有所下降但是仍接近五分之一。“醫院進一批藥，如不及時用就會過期報廢，抗生素比其他藥相對貴一些，如果醫院用不掉，經濟損失很大。”王愛霞說。